SARS-CoV-2 Reinfections (3 case studies)
Los primeros casos de reinfección por SARS COV 2
The first cases of reinfection by SARS VOC 2
Evidencia genómica de reinfección con SARS-CoV-2: un estudio de caso
Genomic evidence of reinfection with SARS-CoV-2: a case study
Bibliografía de texto e imágenes:
Text and Image Bibliography:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1473309920307647
En este caso de estudio se presenta un hombre de 25 años cursando re-infección viral por SARS COV 2, paciente que reside en Nevada que presentó a las autoridades de salud una prueba positiva para SARS COV 2 en abril del 2020 y luego para Junio del 2020. A este paciente se le hicieron dos pruebas de confirmación, una en donde se amplificaban los ácidos nucleicos virales, y de ahí se determinaron y compararon con la secuencia de ácidos nucleicos del coronavirus. Las muestras fueron extraídas por exudado nasofaringeo y se usaron dos metodologías de bioinformaticas diferentes, estas pruebas fueron en un intervalo entre Mayo y Junio en donde hubo dos pruebas negativas, los análisis genómico de SARS- CoV-2 mostró diferencias genéticamente significativas entre cada variante asociada con cada caso de infección. La segunda infección fue sintomáticamente más grave que la primera. La exposición previa al SARS-CoV-2 podría no garantizar la inmunidad total en todos los casos lo que recalca la importancia del uso de medidas de bioseguridad aún tras haber sido infectado por el virus previamente.
¿Por qué ocurren las reinfecciones?
Cursar con infección viral para SARS COV 2 forma auticuerpos neutrolizantes detectados en el plasma de los pacientes convalecientes sin embargo no se puede asegurar el grado de respuesta inmunologíca de cada paciente ante la infección, si la respuesta inmunología es baja no existirá protección para la siguiente exposición al virus.
In this case study, a 25-year-old man is undergoing viral re-infection by SARS COV 2, a patient residing in Nevada who presented a positive test for SARS COV 2 to the health authorities in April 2020 and then in June of 2020. This patient underwent two confirmation tests, one in which the viral nucleic acids were amplified, and from there they were determined and compared with the nucleic acid sequence of the coronavirus. The samples were extracted by nasopharyngeal exudate and two different bioinformatics methodologies were used, these tests were in an interval between May and June where there were two negative tests, the genomic analysis of SARS-CoV-2 showed genetically significant differences between each associated variant. with each case of infection. The second infection was symptomatically more severe than the first. Previous exposure to SARS-CoV-2 may not guarantee total immunity in all cases, which underscores the importance of using biosecurity measures even after having been previously infected with the virus.
Why do reinfections occur?
Cursing a viral infection for SARS COV 2 forms neutralizing autibodies detected in the plasma of convalescent patients, however, the degree of immunological response of each patient to the infection cannot be assured, if the immunological response is low there will be no protection for the next exposure to the virus.
El paciente presentado anteriormente no presentaba enfermedades previas y refiere inicio de sintomatologias en marzo del 2020 con dolor de garganta, tos, dolor de cabeza, náuseas y diarrea, que se resolvieron para finales de abril, estando él asintomatico hasta finales de mayo donde presentó fiebre, dolor de cabeza, mareos, tos, náuseas y diarrea, se encontraba hipoxemico y con dificultad respiratoria.
¿Qué podemos concluir?
La infección previa por el SARS COV 2 no se traduce con inmunidad garantizada, la segunda infección no necesariamente será más leve que la primera, es necesario ***seguir con las medidas de protección posterior a la infección por coronavirus.
Mecanismos que podrían explicar una infección secundaria más grave.
- Dosis más alta del virus en la segunda infección.
- Reinfección causada por una versión del virus más virulenta o más virulenta en el contexto de este paciente.
El individuo no tenía trastornos inmunológicos. No estaban tomando ningún fármaco inmunosupresor. No tenía infección por HIV.
Hay ciertos datos que no se pueden dilucidar
- El paciente pudo no haber tenido una reinfección sino haber presentado las dos cepas del virus de manera simultanea en donde la cepa del mes de marzo se presentó primero, hubo una coinfección al terminar la infección de la cepa primaria. y la cepa secundaria no tenía gran carga viral para ser detectada por las pruebas (las dos que resultaron negativas) y luego se manifestó la segunda infección con un sistema inmune debilitado por la primera enfermedad.
The previously presented patient had no previous illnesses and reported onset of symptoms in March 2020 with a sore throat, cough, headache, nausea and diarrhea, which resolved by the end of April, he was asymptomatic until the end of May where he presented fever. , headache, dizziness, cough, nausea and diarrhea, he was hypoxemic and with respiratory distress.
What can we conclude?
Previous infection by SARS COV 2 *** does not translate into guaranteed immunity, *** the second infection *** will not necessarily be milder than the first, *** it is necessary *** to continue with the protective measures after coronavirus infection.
Mechanisms that could explain a more serious secondary infection.
- Higher dose of the virus in the second infection.
- Reinfection caused by a more virulent or more virulent version of the virus in the context of this patient.
The individual had no immune disorders. They were not taking any immunosuppressive drugs. He did not have HIV infection.
There are certain data that cannot be elucidated
- The patient may not have had a reinfection but instead presented the two virus strains simultaneously, where the March strain appeared first, there was a co-infection at the end of the primary strain infection. and the secondary strain did not have a large viral load to be detected by the tests (the two that were negative) and then the second infection manifested with an immune system weakened by the first disease.
Bibliografía: https://papers.ssrn.com/sol3/papers.cfm?abstract_id=3686174
Reinfección de COVID-19 por una variante de SARS-CoV-2 filogenéticamente distinta, primer evento confirmado en América del Sur.
Reinfection of COVID-19 by a phylogenetically different variant of SARS-CoV-2, the first confirmed event in South America.
En este caso tenemos un paciente que resultó positivo para SARS-COv2 rt-PCR entre Mayo y Junio 2020, el paciente residía en Ecuador. El paciente tuvo una enfermedad leve en su primera infección y más grave en la segunda, con una prueba negativa dos semanas después de haber recibido el alta y la resolución de la sintomatología.
Se extrajo ARN total (de ambas muestras) analizadas por Oxford Nanopore MinION usando un protocolo de PCR de labranza desarrollado por ARTIC-Network, se investigaron los anticuerpos IgM e IgG anti-SARS-CoV-2 y se observaron niveles más elevados de IgM e IgG específicas de SARS-CoV-2 durante el segundo evento. Los genomas aislados fueron diferentes , el de la primera infección B1.p9 GISAID mientras que la variante asociada con el segundo episodio se asignó A.1.1 GISAID.
In this case we have a patient who tested positive for SARS-COv2 rt-PCR between May and June 2020, the patient resided in Ecuador. The patient had a mild disease in his first infection and more serious in the second, with a negative test two weeks after being discharged and the symptoms resolved.
Total RNA was extracted (from both samples) analyzed by Oxford Nanopore MinION using a tillage PCR protocol developed by ARTIC-Network, anti-SARS-CoV-2 IgM and IgG antibodies were investigated and higher levels of IgM and IgM were observed. SARS-CoV-2 specific IgGs during the second event. The isolated genomes were different, that of the first infection B1.p9 GISAID while the variant associated with the second episode was assigned A.1.1 GISAID.
Síndrome respiratorio agudo severo sintomático Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) Reinfección por una cepa filogenéticamente distinta
Symptomatic severe acute respiratory syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) Reinfection by a phylogenetically distinct strain
Bibliografía: https://academic.oup.com/cid/article/73/2/354/5901661
Presentamos aquí una reinfección sintomática 93 días después de una infección moderada por SARS-CoV-2. Mujer bélgica de 52 años, con antecedentes patológicos conocidos de asma, tratada con corticoides inhalados diarios (los corticoides suelen inmunodeprimir como efecto adverso) inicia enfermedad actual de primera infección para Mayo 2020 con síntomas de dolor de cabeza, fiebre, mialgia, tos, dolor en el pecho y dificultad respiratoria, ausencia del olfato y gusto, una saturación de oxigeno del 94%, con un hisopo nasofaríngeo dio positivo con la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) del SARS-CoV-2.
Tres meses después del primer episodio, la paciente experimentó una recaída de los síntomas con dolor de cabeza, debilidad, tos y rinitis, clínica mucho más leve que la primera, con un hisopado nasofaríngeo fue nuevamente positivo para SARS-CoV-2. El paciente dio positivo en anticuerpos anti-nucleocápsida del SARS-CoV-2
Secuencia genomica de las cepas
We present here a symptomatic reinfection 93 days after a moderate SARS-CoV-2 infection. 52-year-old Belgian woman, with a known pathological history of asthma, treated with daily inhaled corticosteroids (corticosteroids usually immunosuppress as an adverse effect) begins current disease of first infection by May 2020 with symptoms of headache, fever, myalgia, cough, pain in the chest and respiratory distress, absence of smell and taste, an oxygen saturation of 94%, with a nasopharyngeal swab it was positive with the polymerase chain reaction (PCR) of SARS-CoV-2.
Three months after the first episode, the patient experienced a relapse of symptoms with headache, weakness, cough and rhinitis, symptoms much milder than the first, with a nasopharyngeal swab she was again positive for SARS-CoV-2. Patient tested positive for SARS-CoV-2 nucleocapsid antibodies
Genomic sequence of the strains
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