How is the scientist work: in the track of antibiotics resistance.

  I looked for a scientific career for two main things: 1: To satisfy my curiosity about a specific topic that I liked and 2: To make a difference as a world citizen. I changed a bit the focus in my career, for many years I was trying to help unveil the mysteries of cancer, and decided to give more of a focus on personal growth. Because of that, I started to look for a job with a more stable condition in my career which the academic path couldn't provide me.

  I finally found a job that could provide me a raise every year, plus a good retirement plan. The contract is for 5 years which isn't bad. However, I changed a bit my subject in research but still, I am doing something that can help people's lives. I work on a project that deals with Antimicrobial resistance (or AMR). Everybody used it once at least antibiotics medicines. This medicine is used to fight microorganisms called Bacteria. Not only people are susceptible to bacteria, but animals and plants also can be harmed by these little beings. Because of that, people also use them in animals and soil to protect plants, mainly on farms. However, the overuse of this medicine can cause bacteria to create resistance, these super bacteria that resist antibiotics can be found in people, especially in hospitals, in farm products that you find in the supermarket, and even in the environment, such as wastewater.

  This is called AMR. The project that I work with is an effort to gather all the country's biological data in one single system, where researchers can access and ask different questions using tons of different data coming from farms, the environment, food products, and even hospitals. People would be able to see how is the transmission of different resistant bacteria through all these levels, including specific characteristics of these bacteria. For example, we can make the association between a resistant bacteria found in different patients in a specific hospital with maybe the occurrence also in a farm or a specific environment.

  My contribution to this project is building the computational system, including the database to store this data and visualization app. I am a bioinformatician. Bioinformatics is an inter-discipline that uses biology, IT knowledge, math, and physics. So I am a biologist with computer skills. I like this since my experiments depend on computers, I wrote a bit about that before. I think I wouldn't change to another biology area right now, since it praises me having control over what the computer will give me. However, currently, my job is more with IT than biology, I would love to do more science questions instead of building a system or a tool for others. But I see my current job as a good way to get more programming experience, which is also cool.

  I think that my current job is going to bring a good overview of what is happening with antibiotic resistance in the country and the product of that work will help people to understand better how and why some outbreaks of these pathogens can occur. For sure after my contract is done in the next 3 years, I will change a bit my project, a with some luck I can continue in this job with another project perhaps. Academic pressure to get grants in addition to not well-paid jobs is something that made me a bit disappointed with the area. And it is something that I am not sure if I would be back, but who knows the future?

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  Busquei uma carreira científica por duas razões principais: 1: Para satisfazer minha curiosidade sobre um tópico específico que eu gostava e 2: Para fazer diferença como cidadão do mundo. Mudei um pouco o foco na minha carreira, por muitos anos estava tentando ajudar a desvendar os mistérios do câncer e decidi dar mais ênfase ao crescimento pessoal. Por causa disso, comecei a procurar um emprego com condições mais estáveis na minha carreira, que o caminho acadêmico não poderia me proporcionar.

  Finalmente encontrei um emprego que poderia me proporcionar um aumento a cada ano, além de um bom plano de aposentadoria. O contrato é de 5 anos, o que não é ruim. No entanto, mudei um pouco o meu tema de pesquisa, mas ainda estou fazendo algo que pode ajudar na vida das pessoas. Trabalho em um projeto que lida com a resistência antimicrobiana (ou AMR). Todo mundo usou pelo menos uma vez medicamentos antibióticos. Este medicamento é usado para combater microorganismos chamados bactérias. Não apenas as pessoas são suscetíveis a bactérias, mas animais e plantas também podem ser prejudicados por esses pequenos seres. Por isso, as pessoas também os usam em animais e solo para proteger as plantas, principalmente em fazendas. No entanto, o uso excessivo deste medicamento pode fazer com que as bactérias criem resistência. Essas superbactérias que resistem aos antibióticos podem ser encontradas em pessoas, especialmente em hospitais, em produtos de fazenda que você encontra no supermercado e até mesmo no meio ambiente, como águas residuais.

  Isso é chamado de AMR. O projeto em que trabalho é um esforço para reunir todos os dados biológicos do país em um único sistema, onde os pesquisadores podem acessar e fazer diferentes perguntas usando toneladas de dados diferentes provenientes de fazendas, meio ambiente, produtos alimentícios e até mesmo hospitais. As pessoas seriam capazes de ver como é a transmissão de diferentes bactérias resistentes por todos esses níveis, incluindo características específicas dessas bactérias. Por exemplo, podemos fazer a associação entre uma bactéria resistente encontrada em diferentes pacientes em um hospital específico com talvez a ocorrência também em uma fazenda ou ambiente específico.

  Minha contribuição para este projeto é construir o sistema computacional, incluindo o banco de dados para armazenar esses dados e o aplicativo de visualização. Sou um bioinformático. Bioinformática é uma interdisciplina que utiliza biologia, conhecimento em TI, matemática e física. Então sou um biólogo com habilidades em computação. Gosto disso, já que meus experimentos dependem de computadores, escrevi um pouco sobre isso antes. Acho que não mudaria para outra área da biologia agora, já que me agrada ter controle sobre o que o computador vai me fornecer. No entanto, atualmente, meu trabalho é mais com TI do que com biologia, adoraria fazer mais perguntas científicas em vez de construir um sistema ou uma ferramenta para outros. Mas vejo meu trabalho atual como uma boa maneira de obter mais experiência em programação, o que também é legal.

  Acredito que meu trabalho atual vai trazer uma boa visão do que está acontecendo com a resistência aos antibióticos no país e o produto desse trabalho ajudará as pessoas a entenderem melhor como e por que alguns surtos desses patógenos podem ocorrer. Com certeza, depois que meu contrato terminar nos próximos 3 anos, vou mudar um pouco meu projeto e, com um pouco de sorte, posso continuar neste emprego com outro projeto talvez. A pressão acadêmica para obter bolsas, além de empregos mal remunerados, é algo que me deixou um pouco decepcionado com a área. E é algo que não tenho certeza se voltaria, mas quem sabe o futuro?

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